Das Generalsekretariat pflegt die Beziehungen der AİF zu anderen gesellschaftlichen Gruppen und wirkt als Ansprechpartner zwischen der Gemeinschaft und der Gesellschaft.

Neben der Koordinierung der zentralen Administration, gehört die Öffentlichkeitsarbeit und die Regie von Großveranstaltungen der Organisation zu den wichtigsten Aufgabenbereichen des Generalsekretariats. Darüber hinaus werden die Webseiten www.islamfederasyonu.at und www.avusturyafuari.at vom Generalsekretariat betreut.